MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 9886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011989	GGC	2	6	1516178	1516183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_011989	CTGC	2	8	1516200	1516207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_011989	TTC	2	6	1516230	1516235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_011989	TG	3	6	1516275	1516280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011989	G	6	6	1516312	1516317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011989	AGGCAA	2	12	1516366	1516377	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4007	NC_011989	GACA	2	8	1516418	1516425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_011989	CGAAC	2	10	1516983	1516992	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4009	NC_011989	CT	3	6	1517419	1517424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_011989	ATT	2	6	1517448	1517453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_011989	TGA	2	6	1517559	1517564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_011989	GCC	2	6	1517580	1517585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_011989	GC	4	8	1521794	1521801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_011989	GC	4	8	1521810	1521817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_011989	TCC	2	6	1521820	1521825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_011989	GCA	2	6	1526182	1526187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_011989	A	6	6	1526196	1526201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011989	GCC	2	6	1526202	1526207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_011989	GGC	2	6	1526220	1526225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_011989	ATG	2	6	1526237	1526242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_011989	TCT	2	6	1527092	1527097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_011989	GCC	2	6	1527114	1527119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_011989	CCG	2	6	1527213	1527218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_011989	CCG	2	6	1527275	1527280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_011989	GGCA	2	8	1527284	1527291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_011989	TTC	2	6	1527301	1527306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_011989	AGT	2	6	1527472	1527477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_011989	CTT	2	6	1528125	1528130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_011989	GA	3	6	1528183	1528188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011989	CCG	2	6	1530813	1530818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_011989	CTT	2	6	1532093	1532098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_011989	AGC	2	6	1532163	1532168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_011989	CTC	2	6	1532175	1532180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_011989	GGCC	2	8	1532295	1532302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_011989	AAGG	2	8	1532709	1532716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011989	TGGAA	2	10	1532776	1532785	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_011989	CAATC	2	10	1535963	1535972	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4038	NC_011989	GC	3	6	1536667	1536672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_011989	AGA	2	6	1537331	1537336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011989	ACC	2	6	1537705	1537710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_011989	TCC	3	9	1537720	1537728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_011989	ACG	2	6	1539058	1539063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_011989	AGA	2	6	1539069	1539074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011989	ACAG	2	8	1539828	1539835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_011989	CG	3	6	1540383	1540388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_011989	GCC	2	6	1540760	1540765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_011989	GAAAA	2	10	1540876	1540885	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_011989	A	6	6	1540882	1540887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011989	GGA	2	6	1541687	1541692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_011989	TG	3	6	1542233	1542238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011989	GGC	2	6	1542253	1542258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_011989	ATC	2	6	1542281	1542286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_011989	AGC	2	6	1542329	1542334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_011989	GT	3	6	1542339	1542344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_011989	A	6	6	1542348	1542353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_011989	GA	4	8	1542448	1542455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_011989	GCC	2	6	1542491	1542496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_011989	GC	3	6	1544570	1544575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_011989	TTC	2	6	1544605	1544610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_011989	GGA	2	6	1544615	1544620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_011989	TTG	2	6	1544643	1544648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011989	CGG	2	6	1544666	1544671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_011989	AC	3	6	1544693	1544698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_011989	TTG	2	6	1545152	1545157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_011989	CGG	2	6	1545207	1545212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_011989	TTC	2	6	1545632	1545637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_011989	CCGG	2	8	1545640	1545647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4068	NC_011989	TTC	2	6	1545671	1545676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_011989	GTC	2	6	1545686	1545691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_011989	CGA	2	6	1545707	1545712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_011989	CAA	2	6	1546821	1546826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_011989	GTTT	2	8	1547304	1547311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_011989	T	6	6	1547347	1547352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_011989	GATT	2	8	1547422	1547429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_011989	AAG	2	6	1547473	1547478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_011989	TCC	2	6	1547485	1547490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_011989	GT	3	6	1548665	1548670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_011989	CAA	2	6	1548793	1548798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_011989	A	6	6	1548871	1548876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_011989	A	6	6	1548904	1548909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_011989	CATC	2	8	1548940	1548947	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_011989	GC	3	6	1548999	1549004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_011989	AT	3	6	1549060	1549065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_011989	GGTG	2	8	1549097	1549104	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_011989	ATG	2	6	1549142	1549147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_011989	ACA	2	6	1549364	1549369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_011989	CG	3	6	1549403	1549408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_011989	A	6	6	1549428	1549433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_011989	CGA	2	6	1549439	1549444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_011989	CCT	2	6	1549460	1549465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_011989	CGA	2	6	1549487	1549492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_011989	GA	3	6	1549510	1549515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_011989	TCA	2	6	1549546	1549551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_011989	CTGAA	2	10	1550146	1550155	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4095	NC_011989	TC	3	6	1551664	1551669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4096	NC_011989	GT	3	6	1553491	1553496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011989	CGC	2	6	1555161	1555166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_011989	ATC	2	6	1555220	1555225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_011989	GAA	2	6	1555357	1555362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_011989	GCT	2	6	1555424	1555429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_011989	TCC	2	6	1555547	1555552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_011989	CTTT	2	8	1558364	1558371	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_011989	AT	3	6	1558405	1558410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_011989	CG	3	6	1558422	1558427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_011989	TGC	2	6	1558462	1558467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_011989	TCAT	2	8	1558496	1558503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_011989	GAA	2	6	1562054	1562059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_011989	AGGGC	2	10	1563306	1563315	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4109	NC_011989	CGG	2	6	1563397	1563402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_011989	A	7	7	1564110	1564116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_011989	GCC	2	6	1564290	1564295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_011989	GAT	2	6	1565285	1565290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_011989	GAA	2	6	1565306	1565311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_011989	ATC	2	6	1565313	1565318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_011989	A	8	8	1565391	1565398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_011989	CTT	2	6	1567766	1567771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_011989	ACA	2	6	1567804	1567809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_011989	TGG	2	6	1567838	1567843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_011989	GT	3	6	1567866	1567871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011989	TCA	2	6	1567880	1567885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_011989	CG	3	6	1568893	1568898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_011989	AT	3	6	1568905	1568910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_011989	GTC	2	6	1568912	1568917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_011989	GGC	2	6	1568932	1568937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_011989	CT	3	6	1568945	1568950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_011989	GCC	2	6	1570128	1570133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_011989	ATGGTG	2	12	1574567	1574578	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_011989	ATC	2	6	1574637	1574642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_011989	GGC	2	6	1574670	1574675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_011989	CAT	3	9	1574861	1574869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_011989	GAT	2	6	1575508	1575513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_011989	GC	3	6	1575604	1575609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_011989	AAG	2	6	1575999	1576004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4263	NC_011989	CG	3	6	1613955	1613960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4392	NC_011989	T	6	6	1657192	1657197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4394	NC_011989	GGA	2	6	1657277	1657282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_011989	TCA	2	6	1657361	1657366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4399	NC_011989	TTC	2	6	1657650	1657655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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